软件界面如图：

全局参数：

站点开设路径：可以自定义设置，建议保持默认，请不要选择在C盘。
Mysql安装路径：建议保持默认，如果有自己安装的版本请选择自己安装的路径
Mssql存储路径：建议保持默认。
Mysql_root密码：默认为root3306，若需修改，请填写新的密码，然后点后边的“尝试重置”。
PHP5.2安装路径：建议保持默认。
PHP5.3安装路径：建议保持默认，若没安装，请留空。
IIS日志目录：建议保持默认，日志在创建站点时可以开启，开启后需要定期清理，以免导致磁盘占满。

从IIS导入数据：此功能暂未开放
导入3.0版数据：此功能用于原来是3.0版本的网站管理助手，升级到4.0后导入网站管理助手站点设置使用
重装恢复：此功能用户保留数据重装系统后，恢复IIS的站点设置使用。

环境安装检测：可以检测当前的服务器及IIS、FTP等服务器环境是否正常，并可单独安装PHP、mysql等环境。注意，环境正常的情况下请勿点击安装环境系统，以免原有数据丢失。

站点迁移：
备份恢复IIS：用于单独备份IIS或恢复IIS站点配置。
重建账号：用于重建创建网站时建立的服务器用户名及密码
重置目录权限：用于重置创建网站的目录权限，若对应的网站目录权限所属用户还未创建，就需要先创建对应用户后再执行重置目录权限操作。

站长工具箱：
编辑HOST文件：可以方便的将某个域名指向一个指定的IP。若保存失败，请检查hosts文件的权限是否只读。
查杀常见木马：可以对网络上一些常见的木马进行查杀，也可以自定义木马特征。扫描后请先确认再清理，清理前最好做个备份，以免误杀。
清理垃圾文件：可以清理系统临时文件及浏览器缓存。
清理缓存：可以扫描清理网站生成的大量缓存文件，以及带点的文件夹或恶意创建的手工无法删除的特殊文件夹或文件。
域名转码查询：主要用户查询中文域名的转码或查询转码对应的中文域名，以及URL对应的编码。